表面微生物的采样方法可分为：


1.  接触式采样，这种采样方法适用于平滑表面，采用接触皿，或其它装在适当容器中的培养基与采样表面接触采样。

2.   间接式采样，适用于大面积，不规则表面或接触装置无法使用的凹面，采用经过灭菌的棉签，对采用表面擦拭采样。